במהלך ההריון יהיו מקרים בהם תזדקקי לטיפול תרופתי. ישנן תרופות רבות שהן בטוחות ומותרות בכל הריון, בכל שבוע ולכל משך זמן.
רשימת התרופות שידועות ככאלו שגורמות למומים בעובר, הן לא רבות ועיקר התרופות הן בקטגוריה "אפורה" כלומר אין עדויות חד משמעיות לבטיחות או למסוכנות שלהם.
כמובן שלא ניתן לפרט את כלל התרופות הבטוחות או האסורות בהריון, ובכל מקרה, עבור כל תרופה יש להתייעץ עם הרופא/ה שלך.
להלן מספר תרופות שכיחות אשר נחשבות בטוחות בהריון:
| קבוצה | שמות לדוגמא | מותר או אסור |
| אנטיביוטיקה | מוקסיפן, אוגמנטין, זינאט, רוליד, מקרודנטין, פלג'יל | מותר |
| טחורים | מותר | |
| אלרגיה | לורסטין, טלפאסט, אהיסטון | מותר |
| בחילות והקאות | פראמין, זופרן, דיקלנטין | מותר |
| חום וכאבים | אופטלגין, אקמול | מותר |
| נגד גודש באף | בהגבלות | |
| סירופ נגד שיעול | בהגבלות | |
| מכייחי ליחה | בהגבלות | |
| חיסונים | שפעת, טטנוס, שעלת | מותר |
